Το 3ο Εργαστηριακό Κέντρο (Ε.Κ.) Λάρισας ιδρύθηκε το 1999 με το ΦΕΚ 1756/20-9-1999. Η αρχική ονομασία ήταν 3ο Σχολικό Εργαστηριακό Κέντρο (Σ.Ε.Κ.) Λάρισας η οποία άλλαξε σε 3ο Ε.Κ. Λάρισας με το Ν.4186/2013 (ΦΕΚ Α’ 193) .

Το 3ο Ε.Κ. Λάρισας, σύμφωνα με το Ν.1318/2015 περί λειτουργίας των Εργαστηριακών Κέντρων, αποτελεί εκπαιδευτική μονάδα του Υπουργείου Παιδείας Έρευνας και Θρησκευμάτων με αυτοτελή διοικητική δομή. Συνεργάζεται με το 7ο ΕΠΑ.Λ Λάρισας, το 4ο ΕΠΑ.Λ Λάρισας και του 3ο Εσπερινό ΕΠΑ.Λ Λάρισας υποστηρίζοντας τα εργαστηριακά μαθήματα όλων των Τομέων και Ειδικοτήτων που λειτουργούν σ’ αυτά.

Στελέχη διοίκησης του 3ου  Ε.Κ. είναι:

• ο Διευθυντής,
• ο Υποδιευθυντής,  
• οι υπεύθυνοι τομέων και
• οι υπεύθυνοι εργαστηρίων κατεύθυνσης

Επίσης λειτουργεί σύλλογος διδασκόντων που συγκροτείται από τους διδάσκοντες με ολική ή μερική διάθεση στα εργαστήρια του 3ου Ε.Κ. με οποιαδήποτε σχέση εργασίας.

Το 3ο Ε.Κ. μεταξύ άλλων :

• καθορίζει τον αριθμό, το είδος και τους χώρους των εργαστηρίων κατεύθυνσης που θα λειτουργήσουν.
• εποπτεύει την κατάλληλη διαμόρφωση και τον εξοπλισμό των εργαστηριακών χώρων, ώστε να μπορεί να υποστηριχθεί η εργαστηριακή άσκηση των μαθητών και η διδασκαλία των αντίστοιχων μαθημάτων.
• εισηγείται στη διεύθυνση δευτεροβάθμιας εκπαίδευσης για το εκπαιδευτικό προσωπικό που απαιτείται για τη λειτουργία του Ε.Κ. και προτείνει τους υπεύθυνους των εργαστηρίων κατεύθυνσης, μετά από εισήγηση του υπεύθυνου του τομέα.
• μεριμνά για την ενημέρωση του προσωπικού σχετικά με τις εξελίξεις της τεχνολογίας στα θέματα που ενδιαφέρουν τα εργαστήρια.
• έχει την εποπτεία για την προληπτική συντήρηση και επισκευή του εξοπλισμού των εργαστηρίων και αναθέτει αυτή στο διδακτικό προσωπικό ή στους συντηρητές του Ε.Κ., με σκοπό την αποφυγή βλαβών και ατυχημάτων.
• στο τέλος κάθε σχολικού έτους φροντίζει για την απογραφή εξοπλισμού των εργαστηρίων που διαθέτει.
• προωθεί και υλοποιεί πρωτοβουλίες σε συνεργασία με την τοπική αυτοδιοίκηση που έχουν σχέση με την Επαγγελματική Εκπαίδευση.
• φροντίζει ώστε οι εργαστηριακοί χώροι να έχουν όλες τις προδιαγραφές που εξασφαλίζουν την ασφάλεια και την υγεία των μαθητών και του εκπαιδευτικού προσωπικού κατά την υλοποίηση των εργαστηριακών ασκήσεων.

Το 3ο Ε.Κ. ως αυτοτελή εκπαιδευτική μονάδα χρηματοδοτείται αυτοτελώς βάσει του αριθμού των μαθητών όλων των σχολικών μονάδων που εξυπηρετεί.

Το 3ο Ε.Κ. υποστηρίζει το θεσμό της μαθητείας παρέχοντας το απαραίτητο εκπαιδευτικό προσωπικό και την απαιτούμενη υλικοτεχνική υποδομή για την πραγματοποίηση των εργαστηριακών μαθημάτων των τμημάτων μαθητείας που υλοποιούνται στα σχολεία με τα οποία συνεργάζεται.